Also wenn du ordentlich Luft im System hast, kann das schon eine ganze Weile dauern. Ich kenne das noch vom Injektor Wechsel, da war nur der Hochdruck Teil leer und ich habe echt lange orgeln müssen und am Injektor einen nach dem anderen entlüften.
Du solltest zuerst zusehen, dass der niederdruck Teil auf jeden Fall mit Kraftstoff gefüllt ist - also Schlauch am Dieselfilter in Richtung HD Pumpe abnehmen und die Kraftstoffpumpe ansteuern, bis da was kommt. Dann am Rail öffnen und warten bis da was kommt. So kannst dich bis zu den Injektoren durcharbeiten.
Gibt dem Anlasser immer wieder genug Zeit zum abkühlen und hänge vielleicht noch eine zweite Batterie dran zur Unterstützung.
BTW - wie schafft man denn bitte ein Auto so leer zu fahren? Das ist echt keine gute Idee.